Προγραμματικές συμβάσεις Ο.Τ.Α. α΄ βαθμού με Αναπτυξιακούς Οργανισμούς ΟΤΑ∙ όλες οι αναλαμβανόμενες οικονομικές υποχρεώσεις πρέπει να συνδέονται, ευθέως και κατά τεκμηριωμένο τρόπο, με δαπάνες που πραγματοποιούνται ειδικά στο πλαίσιο της συγκεκριμένης προγραμματικής σύμβασης και είναι απαραίτητες για την υλοποίηση του αντικειμένου της∙ λειτουργικά έξοδα προγραμματικής σύμβασης∙ περιπτωσιολογία άμεσων και έμμεσων δαπανών∙ κόστος αμοιβών τακτικού προσωπικού Αναπτυξιακού Οργανισμού∙ καλύπτεται αποκλειστικά από τον τακτικό προϋπολογισμό του∙ οποιαδήποτε άλλη δαπάνη (π.χ. υπερωριακή ή πρόσθετη) του τακτικού προσωπικού του, η οποία βαρύνει τον προϋπολογισμό της σύμβασης, επιβάλλεται να αιτιολογείται ως προς το ύψος και τον επιμερισμό της ανάμεσα στους αντισυμβαλλόμενους∙ μισθολογικό κόστος έκτακτου προσωπικού∙ η σύννομη συμπερίληψή του στις άμεσες δαπάνες της σύμβασης προϋποθέτει την ανάλυσή του και τη στοιχειοθέτηση της οικονομικότητάς του κατά τρόπο που μπορεί να ελεγχθεί αντικειμενικά∙ για τον υπολογισμό των έμμεσων δαπανών, αυτές ενδέχεται να υπολογίζονται κατ΄ αποκοπή ως σταθερό ποσοστό επί των άμεσων δαπανών∙ μεθοδολογία υπολογισμού∙ σε κάθε περίπτωση, η μέθοδος που επιλέγεται πρέπει να προβλέπεται ρητά στη σύμβαση ή στο σχετικό παράρτημα κοστολόγησής της, ο καθορισμός των δαπανών να στηρίζεται σε προϋπολογιστικά στοιχεία κόστους για κάθε κατηγορία δαπάνης, να τεκμηριώνεται ο εύλογος χαρακτήρας τους, λαμβάνοντας υπόψη και τις απαιτήσεις της βιωσιμότητας του Αναπτυξιακού Οργανισμού∙ ο επιμερισμός αυτών των δαπανών πρέπει να τεκμηριώνεται λογιστικά και να είναι διαφανής, αποκλειομένης σε κάθε περίπτωση της διπλής χρηματοδότησης μιας δαπάνης, ήτοι της εμφάνισής της τόσο ως άμεσης όσο και ως έμμεσης στο πλαίσιο της ίδιας σύμβασης, ή της ταυτόχρονης χρηματοδότησής της από διαφορετικές συμβάσεις∙ εξάλλου, συνιστά βέλτιστη πρακτική η ανά έτος ή ανά φάση της σύμβασης αναθεώρηση της κατανομής τους, ώστε ο επιμερισμός τους να αντανακλά τις αλλαγές σε ανθρώπινο δυναμικό, τα νέα έργα που προστίθενται και εκείνα που ολοκληρώνονται, και την αλλαγή στο κόστος των γενικών εξόδων.